O interessante aqui é que não é uma projeção de cor, os valores de matiz estão confusos. Não é apenas que todas as cores foram empurradas para o roxo, o que pode acontecer para certas configurações de equilíbrio de branco, o que realmente aconteceu é que todas as cores foram alteradas em torno da roda de cores, azul / ciano -> roxo, laranja / marrom -> verde.
Esta é a parte direita da primeira imagem, com o matiz deslocado 16 graus para a esquerda:
Quando comparando o lado esquerdo as cores não são exatamente corretas, mas muito próximas:
Isso para mim indica que não há nada que você tenha feito errado, este é um bug no Photomatix. Ou a representação interna usa um espaço de cores no estilo YUV e está sofrendo de algum tipo de erro de deslocamento, ou sua câmera tem corantes um tanto fora do padrão no CFA e o Photomatix está usando o perfil de câmera errado ao demosaicing as imagens RAW, resultando nas cores sendo alteradas como os valores de azul são interpretados incorretamente.
Meu dinheiro está na segunda explicação, pois vi resultados muito semelhantes ao fazer conversões RAW no Lightroom se você modificar o matiz do azul primário no perfil da câmera.
Uma maneira fácil de verificar essa hipótese é converter suas imagens em TIFFs de 16 bits e importá-las para o Photomatix. Se for esse o caso, pode haver algumas configurações no Photomatix relacionadas à conversão de RAW. Caso contrário, você terá que apresentar um relatório de bug. Enquanto isso, você deve ser capaz de mudar suas cores de volta usando a caixa de diálogo Hue / Saturation / Lightness no Photoshop / GIMP.